Это слишком сложная тема для того чтобы рассмотреть её в одном посте.
Но вам вовсе не обязательно строить ядро системы самому с нуля. Я бы рекомендовал обратить своё внимание на Фреймворки.
Например Yii или Zend.

Zend один из лучших фраемворков, на котором можно сделать все что угодно, тем более, что ЗЕНД разрабатывали сами разработчики PHP + включено в ПХП

Zend eto horosho no hotelos` by ponimat` vse momenty. Da i dlya samogo sebya interesno kak tam vse krutitsya.

ya vot k primeru predstavlenie imeu o MVC i OOP no kak realizovat` kakoito proect postroennyi na klassah ya nikak ne poimu =(

P.S sorry za latinicu, posle pereustanovki WINXP russkii neho4et vklu4atsya =(

А что нужно понимать. Класс -- это обект, после создание которого ты сможеш делать какие-то операции.
Вот припустим есть класс для БД (мускула). Вот и через него ты можеш себе спокойно подключатся к БД, отправлять запросы, делать какие-то другие операции, которые будут описаны в нем. И все это в одном обекте. =)

Вот припустим ты далеш какую-то прогу, которая сильно связана с БД. Так береш класс БД, и унаследуеш его, добавлеш еще функции, которые тебе нужны будут.

И т.д., пока не достигнеш делаемого результата.

оно и понятно, допустим есть Controller и есть куча библотек для работы допустим с тойже MYSQLI, templates, Request и т.д
Вот как бы их так обьединить всех в одном контроллере и работать дальше ....
Как-бы проблем особых несоставит писать код процедурным методом а часть писать на классах, но хотелось бы всё в классы перетащить, типо framework =)

Это не всегда нужно.
Нужно подгружать библии только тогда, когда они нужны.
Вот создайте класс, и создайте к нему метод, который будет подгружать библию, модуль и т.д.
Для этого нужно придумать свой механизм подгрузки и их контроля.
Выше верно сказали, в одной теме в этом не опишется даже 2% всего, что можно сделать. По этой теме можно целую книгу написать!

MVC - model-view-controller. Здесь моделью выступаеш Ваша БД. View - Ваш шаблон на базе smarty или xtemplate, или своего шаблонизатора. Контроллером выступает именно Ваш php-код. Для начала надо написать класс, который потом будут наследовать все классы Вашей будущей CMS. В этот класс запихнуть основные методы для работы с данными, которые будете вытаскивать из БД, xml, файлов и пр. Тоесть, в этот класс стоит вписать основу работы Вашего движка: добавление, изменение, удаление записей в БД, загрузка, удаление файлов, парсинг полученых файлов и данных, передача результатов шаблонизатору.

Для того, чтобы начать, надо на бумаге, или на компе, написать список, чего Вы хотите от ядра. Какие-то custom функциональности лучше разнести по модулям. Например, методы управления регистрацией и авторизацией пользователей лучше вынести в отдельный модуль.

По поводу того, как все это слепить: сначала подгружаете основной класс, шаблонизатор, а потом подгружаете классы модулей.

Да, в оном посте просто так не опишешь.

может сможем с вами в скайпе поболтать? =)

Есть краткий курс про приницпы mvc в java. Учитывая, что джава полностью ООП, можно проследить принцип).