замените
[PHP]for($i=0; $i < $res_num; $i++) {echo $result[$i];}[/PHP]
на
[PHP]print_r($result);[/PHP]
и я думаю вам всё станет ясно)

Говорит
Что-то пока не ясно. Оно вывело последние элементы массивов, да? То есть весь массив в $result не попадает? Или нет... Я просто не понимаю, что попало в $result... ТО есть по какому принципу?

Если я верно понял, нужно слить два или более массива в едино целое.
Тогда может пойти в помощь функция array_merge и array_merge_reqursive, хотя если честно, у них есть некоторые баги, что даже очень даже бесит...
В результате:
[PHP]
/*---------------------------------------------------------
Функция рекрусивной замены массивов
Стек главного массива имеет жесткую ссылку
---------------------------------------------------------*/
function arrayMerge($ARRAY, &$HEYSTACK){
$KEY["ARRAY"] = array_keys($ARRAY);
for($i = 0; $i < count($KEY["ARRAY"]); $i++){
$NOW_KEY_ARRAY = $KEY["ARRAY"][$i];
if(is_array($ARRAY[$NOW_KEY_ARRAY])){
arrayMerge($ARRAY[$NOW_KEY_ARRAY], $HEYSTACK[$NOW_KEY_ARRAY]);
}else/*if(is_string($ARRAY[$NOW_KEY_ARRAY]) || is_integer($ARRAY[$NOW_KEY_ARRAY]))*/{
$HEYSTACK[$NOW_KEY_ARRAY] = $ARRAY[$NOW_KEY_ARRAY];
}
}
}
[/PHP]

Если уж нужно сравнить файлы на идентичность текстов или другого наполнения, тогда наверное md5 и может serialize (мое мнение), поскольку сравнения очень огромных строк теряет ОЧЕНЬ МНОГО РЕСУРСОВ, не заикаясь уж о веремни.
[PHP]
$f1 = '1.txt';
$f2 = '2.txt';

$hex1 = md5(file_get_contents($f1));
$hex2 = md5(file_get_contents($f2));
if($hex1 == $hex2){ $IDENTY = true; }
else{ $IDENTY = false; }
[/PHP]

в ресульт попадает то что есть в первом массиве и нет во втором, то есть z но с индексом с первого массива то есть 6
[5] => y скорей всего у вас после одного y стоит перенос строки а после второго не стоит вот y и попал

ZhukV, нет, я хочу просто получить строки из первого файла, не содержащиеся во втором. Как это делает функция array_diff. Только почему она работает не так, как написано, я не понимаю.

alexdrob, точно, про перенос я и не подумал)

Ну а почему вот такой цикл-то ничего не выводит?..
[php]<?php
$array01 = file('test01.txt');
$array02 = file('test02.txt');
$result = array_diff ($array01, $array02);
for ($i=0;$i<count($result);$i++) {
echo $result[$i];
}
?>[/php]Хотя [php]print_r($result);[/php] , и если ставить ограничение для $i не count($result), а 7 - то все выводится. Т.е. не понятно, почему индексом для "z" выводится 6, а не 0...

цикл
$i=0;$i<count($result)
что сделает?
i=0 пока меньше 1го i++
result[0] = не существует
у вас индекс 6

[PHP]<?php
$array01 = file('test01.txt');
$array02 = file('test02.txt');
$result = array_diff ($array01, $array02);
foreach ($result as $k => $v) {
echo $v;
}
?>[/PHP]



то что у вас в первом файле z под индексом 6